[bxmlt] Elena Paslaru: Experiences using Semantic Web Technologies in a Medical Retrieval System

Noch einmal Elena Paslaru. Wie bei ihrem gestrigen Vortrag betont sie, dass die Annahme ihres Vortrags nichts mit dem Fakt zu tun hat, dass ihr Chef Organisator der Konferenz ist. Hm.

Gemeinschaftsprojekt mit dem Institut für Pathologie der Charité Berlin. Alle histologischen Befunde (medizinische Bilddaten), die im täglichen Betrieb anfallen, sollen digital erfasst werden. Jährlich 75.000 Befundbilder. Übliche Lösungen gehen nicht gut: Image Retrieval allein reicht nicht, da auch Ausschnitte der Bilder annotiert werden sollen. Text Retrieval funktioniert für die Pathologieberichte, aber nicht für die Bilder.

Textfragmente der Berichte werden mit Bildausschnitten verknüpft. Inhalt der Texte wird mit medizinischen Ontologien annotiert, um die Suche zu verbessern. Eine Natural Language Processing-Komponente gibt es auch, die ist aber nicht Teil des Vortrags.

Komplexer Ontology Engineering Prozess.

Evaluierung diverser Editoren, Visualisierungstools, Reasoning Engines, Triple Stores. Gut: Protégé, Jena, RACER, FaCT, Sesame

Reasoning ist zur Zeit noch kaum praktikabel, Rules gar nicht.

Um Jena2 kommt man zur Zeit nicht herum.

Ontologien mit mehr als 100 Konzepten sind performancetechnisch unpraktikabel.

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